207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2479 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  59.26 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  59.26 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  59.26 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  68.18 
 
 
72 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  68.18 
 
 
66 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  59.26 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  69.05 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  67.44 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  68.18 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  67.44 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  46.15 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  46.81 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  50.98 
 
 
267 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.51 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  47.73 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  40.74 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  35.85 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  42.31 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  50.94 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  45.1 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  45.83 
 
 
285 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  36.54 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  43.64 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  49.06 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  44.07 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  46.81 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  44 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  48.33 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  46.81 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  44.07 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  35.85 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  42.31 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  43.4 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  44.9 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  36.54 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  42.86 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  38.18 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  46.51 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  38.46 
 
 
71 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  44.83 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  43.18 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  39.66 
 
 
89 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  44.68 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  48.84 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  32.69 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  56.82 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  43.18 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40.91 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  44.68 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  40.82 
 
 
77 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  38.33 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  38.98 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.59 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  46.3 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  45.65 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  45.65 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.49 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  38.46 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  43.9 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  47.06 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  39.22 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  43.4 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.36 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  39.22 
 
 
56 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  39.62 
 
 
65 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  38.46 
 
 
63 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46 
 
 
110 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  40.91 
 
 
81 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  39.22 
 
 
67 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  36.36 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  37.29 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  35.19 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  39.62 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  39.62 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  35.19 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  35.19 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>