27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2445 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  30.47 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  30.47 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  29.87 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  30.47 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  29.22 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  30.14 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  30.26 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  30.82 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  30.82 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  30.82 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  31.01 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  27.94 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  30.23 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  28 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  32.71 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  32.03 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  28.21 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  27.34 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  28.91 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  27.89 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  29.27 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>