More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2389 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  74.79 
 
 		 585 aa  897    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  89.35 
 
 		 574 aa  1071    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  79.52 
 
 		 587 aa  972    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  82.9 
 
 		 574 aa  1002    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 574 aa  1183    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  52.53 
 
 		 815 aa  578  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  51.63 
 
 		 814 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  50.62 
 
 		 808 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  50.7 
 
 		 822 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  50.18 
 
 		 816 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  55.27 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  53.99 
 
 		 633 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  52.95 
 
 		 495 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  50 
 
 		 891 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  47.14 
 
 		 908 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  46.93 
 
 		 824 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  45.5 
 
 		 860 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  53.28 
 
 		 508 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  53.28 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  52.94 
 
 		 873 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  46.5 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  48.44 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  44.2 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  46.2 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  46.33 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  44.73 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  44.4 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  43.57 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  44.02 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  42.95 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  38.02 
 
 		 810 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  43.96 
 
 		 526 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  41.07 
 
 		 496 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  40.73 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  43.06 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.78 
 
 		 508 aa  355  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3176  N-6 DNA methylase  41.05 
 
 		 503 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  39.59 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  40.68 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  42.18 
 
 		 498 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  41.51 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  40.24 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  39.31 
 
 		 847 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  41.16 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  41.02 
 
 		 810 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  41.09 
 
 		 505 aa  345  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  39.84 
 
 		 809 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  40.12 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  39.7 
 
 		 492 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  40.2 
 
 		 814 aa  332  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  40.13 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  38.77 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  39.07 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.38 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  38.61 
 
 		 808 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  37.35 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 522 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  37.9 
 
 		 814 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  38.05 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  38.62 
 
 		 520 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  38.62 
 
 		 520 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  38.27 
 
 		 522 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  37.47 
 
 		 516 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  34.65 
 
 		 799 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  38.19 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  38.57 
 
 		 827 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  38.7 
 
 		 516 aa  314  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  37.3 
 
 		 523 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  36.52 
 
 		 547 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  36.22 
 
 		 871 aa  304  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  37.34 
 
 		 513 aa  302  9e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  37.2 
 
 		 799 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  34.94 
 
 		 544 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  34.64 
 
 		 547 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  36.76 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  38.26 
 
 		 680 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  34.83 
 
 		 540 aa  290  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.88 
 
 		 503 aa  288  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  36.44 
 
 		 576 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  35.78 
 
 		 541 aa  287  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  36.66 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  36.29 
 
 		 528 aa  287  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  36.76 
 
 		 540 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  36.44 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  33.46 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  36.25 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  33.46 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  37.2 
 
 		 543 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  35.73 
 
 		 535 aa  283  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  35.99 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  35.53 
 
 		 544 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  36.5 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.53 
 
 		 855 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  36.48 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  36.11 
 
 		 501 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  37.2 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  35.48 
 
 		 853 aa  280  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  36.23 
 
 		 514 aa  280  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  35.2 
 
 		 523 aa  280  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  37.63 
 
 		 518 aa  280  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>