More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2381 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  100 
 
 		 357 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  47.47 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  47.46 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  47.47 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  45.43 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  48.31 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  45.88 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  44.29 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  44.07 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  43.98 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  46.67 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  45.27 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  45.71 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  45.07 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  42.78 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  45.43 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  41.21 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  43.27 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  44.13 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  41.97 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  40.66 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  43.14 
 
 		 358 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  46.5 
 
 		 364 aa  271  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  41.97 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  44.54 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  44.41 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  41.83 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  43.06 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  45.35 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  45.38 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  45.1 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  44.57 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  45.66 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  45.56 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  43.27 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  43.22 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  43.27 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  43.84 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  42.41 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  43.27 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  42.41 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  45.4 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  45.87 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  41.42 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  43.92 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  43.55 
 
 		 358 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  42.98 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  43.55 
 
 		 358 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  42.74 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  43.55 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  46.67 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  42.22 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  43.06 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  43.06 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  43.06 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  43.06 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3629  alanine racemase  43.79 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000800676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  42.82 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  44.14 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  43.7 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  43.89 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  43.89 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  43.06 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  44.32 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  43.49 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  43.82 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  42.78 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2745  alanine racemase  43.98 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  43.61 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  42.74 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  42.78 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  42.9 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  42.78 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  43.7 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  42.54 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  44.35 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0229  alanine racemase  43.17 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  42.49 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  40.23 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  42.5 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  39.55 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  43.33 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  39.38 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  40.23 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  39.57 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  40.23 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  40.52 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  42.74 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>