More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2250 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  69.2 
 
 
289 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  68.4 
 
 
289 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  67.82 
 
 
289 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  67.36 
 
 
289 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
292 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  63.54 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  63.54 
 
 
298 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  60.84 
 
 
288 aa  388  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 
289 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  60.92 
 
 
289 aa  384  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  61.11 
 
 
292 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
292 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  60.14 
 
 
288 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
292 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
292 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  60.42 
 
 
292 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  59.72 
 
 
288 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  60.42 
 
 
293 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  59.79 
 
 
291 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 
293 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  57.64 
 
 
289 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  59.52 
 
 
298 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  60.42 
 
 
293 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  58.68 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  57.99 
 
 
290 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  57.64 
 
 
289 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  57.84 
 
 
290 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  55.21 
 
 
304 aa  344  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  55.24 
 
 
298 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  54.51 
 
 
302 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  54.51 
 
 
302 aa  334  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
298 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
298 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  54.2 
 
 
298 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.2 
 
 
298 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
298 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
300 aa  311  7.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3681  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
290 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0791735  normal  0.203208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03330  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 
292 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
295 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 
335 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1180  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
326 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
303 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.78 
 
 
293 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
305 aa  228  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  42.71 
 
 
305 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  38.73 
 
 
307 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3105  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
293 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 
293 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  38.76 
 
 
309 aa  221  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  39.22 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
301 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
298 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
299 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 
295 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
301 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.97 
 
 
302 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
298 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
298 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
303 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  39.52 
 
 
302 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  38.36 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.42 
 
 
298 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
298 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
306 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
309 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
299 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 
344 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 
298 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4929  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 
301 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00665073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
322 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
305 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1068  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
313 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
295 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
297 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
305 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
305 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
305 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
297 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
299 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
306 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
305 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>