32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2157 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  44.86 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  47.02 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  48.25 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  45.85 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  41.12 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  41.25 
 
 		 342 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  39.34 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  41.12 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  44.54 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  37.31 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  29.86 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  30.63 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  44.3 
 
 		 172 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  31.9 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  32.03 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  33.01 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  33.64 
 
 		 231 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  31.37 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  34.12 
 
 		 231 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  32.56 
 
 		 188 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  26.47 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  23.4 
 
 		 164 aa  50.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  31.63 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1134 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>