17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2156 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2156  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  266  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2453  hypothetical protein  56 
 
 
132 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0386558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28140  hypothetical protein  64.42 
 
 
132 aa  139  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00031566  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1973  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.182667  normal  0.0517042 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0270  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.57996e-16  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_0296  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0908189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0295  hypothetical protein  36.54 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0254657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0088  hypothetical protein  42.45 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03119  hypothetical protein  31.93 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4195  hypothetical protein  34.91 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0531  hypothetical protein  39.22 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.721524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1111  hypothetical protein  41.35 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.247105  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2525  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1287  hypothetical protein  28.8 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000342569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1827  hypothetical protein  32.32 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1042  hypothetical protein  36.26 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1836  hypothetical protein  24.47 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118115  normal  0.50013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>