More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2075 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 348 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 345 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  39.82 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  33.24 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  39.58 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  29.18 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  27.51 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  28.39 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  29.08 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.01 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  32.07 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 198 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 338 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 385 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.84 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  24.23 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 338 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.53 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  23.57 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1446  transcriptional regulator, AraC family  23.01 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 334 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  25.07 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>