More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1769 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
782 aa  1593    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  43.87 
 
 
785 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  42.73 
 
 
785 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  43.49 
 
 
785 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  43.97 
 
 
779 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  41.71 
 
 
778 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  43.43 
 
 
785 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  43.75 
 
 
786 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 
787 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  38.84 
 
 
783 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.41 
 
 
796 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  41.88 
 
 
772 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
818 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
818 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
833 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
1767 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.81 
 
 
1765 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
1767 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.96 
 
 
1014 aa  334  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
977 aa  333  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1245 aa  331  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
921 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.58 
 
 
1763 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1284 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.76 
 
 
847 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
1768 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1765 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.46 
 
 
923 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
1767 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
1118 aa  326  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1611 aa  325  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  38.05 
 
 
1683 aa  324  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.39 
 
 
1442 aa  323  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1788 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1326 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
1771 aa  321  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
1397 aa  320  9e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1057 aa  317  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.65 
 
 
2213 aa  316  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  38.04 
 
 
1021 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1005 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  39.85 
 
 
977 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
991 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.61 
 
 
852 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
917 aa  313  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  36.71 
 
 
2035 aa  312  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.71 
 
 
1346 aa  313  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.64 
 
 
1177 aa  312  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1363 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
920 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1820 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
964 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  37.96 
 
 
1439 aa  310  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
917 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
916 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
919 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
929 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
816 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
1548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1622 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  30.34 
 
 
833 aa  308  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1033 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
758 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1240 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1305 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
946 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1303 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1165 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.88 
 
 
925 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
990 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
916 aa  303  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.71 
 
 
905 aa  303  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.79 
 
 
1331 aa  303  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1310 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1072 aa  302  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
705 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.36 
 
 
1499 aa  301  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
917 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1340 aa  301  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
1230 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.83 
 
 
925 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  33.55 
 
 
891 aa  299  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
1021 aa  299  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1042 aa  299  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  38.02 
 
 
1030 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1090 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
912 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.71 
 
 
1135 aa  297  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
993 aa  297  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1480 aa  296  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1234 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
1266 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
985 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.89 
 
 
1233 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1009 aa  295  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1202 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1316 aa  293  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 
738 aa  293  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>