More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1726 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  85.53 
 
 
402 aa  714    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  90.38 
 
 
398 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  85.28 
 
 
399 aa  723    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  87.82 
 
 
402 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  89.85 
 
 
400 aa  747    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  89.85 
 
 
400 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  87.59 
 
 
395 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  100 
 
 
395 aa  815    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  58.73 
 
 
418 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  57.47 
 
 
418 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  58.33 
 
 
418 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  57.87 
 
 
418 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  56.06 
 
 
418 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  56.06 
 
 
418 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  56.31 
 
 
418 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  59.64 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  57.22 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  56.85 
 
 
418 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  56.35 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  54.52 
 
 
455 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  53.79 
 
 
426 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  53.55 
 
 
446 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  57.84 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  52.44 
 
 
434 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  54.68 
 
 
418 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  47.72 
 
 
466 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  45.93 
 
 
461 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  56.25 
 
 
272 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  37.91 
 
 
403 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  38.78 
 
 
410 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  35.53 
 
 
440 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  48.15 
 
 
274 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  37.44 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  38.85 
 
 
409 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  35.88 
 
 
409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  35.88 
 
 
414 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.88 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  34.6 
 
 
390 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  37.31 
 
 
401 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  36.14 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.84 
 
 
404 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  34.98 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  35.89 
 
 
404 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  34.65 
 
 
417 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  33.92 
 
 
396 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.34 
 
 
394 aa  215  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.92 
 
 
394 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  33.75 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35 
 
 
396 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  33.66 
 
 
404 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.15 
 
 
404 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.84 
 
 
402 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  32.83 
 
 
395 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.4 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  33.75 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.91 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.97 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  34.16 
 
 
397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.25 
 
 
396 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  34.74 
 
 
387 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  33.92 
 
 
393 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.08 
 
 
395 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  31.91 
 
 
389 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.08 
 
 
404 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  32.34 
 
 
387 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.08 
 
 
404 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  33.33 
 
 
398 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.08 
 
 
404 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.75 
 
 
405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.9 
 
 
391 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  32.41 
 
 
396 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  33.58 
 
 
410 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  34.84 
 
 
402 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.36 
 
 
402 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  30.67 
 
 
397 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  34.59 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.76 
 
 
401 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.25 
 
 
391 aa  183  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.68 
 
 
394 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.68 
 
 
394 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  32.08 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.23 
 
 
404 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  34.22 
 
 
421 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.25 
 
 
417 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  31.57 
 
 
419 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  33.09 
 
 
420 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  31.01 
 
 
419 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  31.06 
 
 
395 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  33.83 
 
 
407 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  32.23 
 
 
399 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.83 
 
 
389 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  30.68 
 
 
424 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.54 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  32.33 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  30.67 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.29 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  30.83 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  30.43 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  32.6 
 
 
420 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>