70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1637 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
504 aa  1005    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 
504 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
501 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
494 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
513 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.71 
 
 
507 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
499 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  23.56 
 
 
516 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
522 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
478 aa  80.1  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
514 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.59 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
519 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  22.99 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
498 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  19.94 
 
 
488 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
488 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  20.34 
 
 
509 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  19.55 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  19.55 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  20.39 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  20.39 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
484 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 
484 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  20.39 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  22.01 
 
 
506 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 
489 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.05 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
424 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 
482 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5386  polysaccharide transport protein, putative  21.17 
 
 
508 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
448 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  22.19 
 
 
486 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13078  putative flippase  22.57 
 
 
508 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.402163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 
488 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 
473 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 
433 aa  47.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
478 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 
418 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
586 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2649  polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 
485 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251579  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
484 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
511 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>