211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1610 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  100 
 
 
383 aa  771  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  31.67 
 
 
386 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  34.42 
 
 
377 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  35.56 
 
 
375 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  37.01 
 
 
374 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  36.42 
 
 
393 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.08 
 
 
392 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  34.32 
 
 
377 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  31.02 
 
 
400 aa  180  5e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  31.51 
 
 
396 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  30.39 
 
 
384 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  33.53 
 
 
377 aa  175  1e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  32.64 
 
 
369 aa  175  1e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.49434e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  34.06 
 
 
385 aa  174  3e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  7.96428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  33.53 
 
 
377 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  33.33 
 
 
388 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.136e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  32.45 
 
 
369 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  32.45 
 
 
369 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.12189e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  32.45 
 
 
369 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.59973e-05  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  31.69 
 
 
367 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.18336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  32.45 
 
 
369 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  32.7 
 
 
382 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  33.13 
 
 
377 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  31.27 
 
 
367 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.54 
 
 
377 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  30.97 
 
 
388 aa  165  1e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.746e-08  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  33.33 
 
 
377 aa  164  2e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  31.18 
 
 
384 aa  164  2e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.77901e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  31.18 
 
 
384 aa  164  2e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.67525e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  33.33 
 
 
377 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  32.34 
 
 
371 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.03666e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  31.13 
 
 
379 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  31.75 
 
 
381 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.4851e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  29.91 
 
 
381 aa  159  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  29.67 
 
 
369 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.46325e-06  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  31.23 
 
 
371 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  31.23 
 
 
371 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  31.23 
 
 
375 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.25 
 
 
388 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  32.65 
 
 
373 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.28628e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  32.65 
 
 
373 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.37804e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.46 
 
 
368 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.20269e-07  hitchhiker  3.05333e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  32.65 
 
 
373 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.24 
 
 
371 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.15292e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  30.66 
 
 
375 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  31.78 
 
 
375 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.19147e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  31.78 
 
 
375 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.40588e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  31.78 
 
 
375 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.13579e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  31.78 
 
 
375 aa  154  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  8.54063e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  31.14 
 
 
374 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  31.58 
 
 
375 aa  153  6e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  31.53 
 
 
374 aa  153  6e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.42967e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  32.59 
 
 
374 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  31.52 
 
 
373 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  28.2 
 
 
370 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  29.67 
 
 
369 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.80385e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  31.49 
 
 
384 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  36.72 
 
 
375 aa  149  1e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  34.2 
 
 
392 aa  147  2e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  31.66 
 
 
403 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  33.33 
 
 
392 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  32.11 
 
 
358 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.38 
 
 
392 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  30.77 
 
 
382 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  33.73 
 
 
379 aa  141  1e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  32.38 
 
 
390 aa  141  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.08089e-09  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.84 
 
 
395 aa  141  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  35.42 
 
 
393 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  32.34 
 
 
384 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  32.34 
 
 
384 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  30.03 
 
 
392 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.38 
 
 
383 aa  140  5e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  29.82 
 
 
427 aa  140  5e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.29 
 
 
382 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  29.51 
 
 
396 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  28.29 
 
 
385 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  28.21 
 
 
385 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  28.66 
 
 
384 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  28.7 
 
 
392 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1668  ribonuclease D  27.12 
 
 
369 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  30.74 
 
 
385 aa  135  1e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  29.38 
 
 
382 aa  135  1e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  26.89 
 
 
385 aa  135  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.4 
 
 
384 aa  134  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  27.76 
 
 
391 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  30.32 
 
 
386 aa  131  2e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81962e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  28.77 
 
 
405 aa  130  4e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  34.16 
 
 
384 aa  129  9e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.57 
 
 
388 aa  129  1e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0801  3'-5' exonuclease  25.78 
 
 
380 aa  129  1e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.963723  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  31.64 
 
 
362 aa  128  2e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  31.64 
 
 
362 aa  128  2e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0795  putative ribonuclease D  25.71 
 
 
432 aa  126  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.16704  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  27.51 
 
 
381 aa  126  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.85 
 
 
389 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>