More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1574 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 343 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.81 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.57 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.66 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.01 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  33.43 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  33.43 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  33.43 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  32.54 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  34.69 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  36.19 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.03 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  36.69 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.97 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  30.12 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.36 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.25 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 320 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  39.44 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  41.99 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  32.9 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 321 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.71 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.15 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.13 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.61 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.57 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  30.19 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.5 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  35.11 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  29.01 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.91 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.01 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.41 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.91 
 
 		 366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  32.84 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  32.56 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.34 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  33.04 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.77 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  31.85 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  32.54 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 		 300 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.98 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  29.56 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  29.46 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  32.65 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.68 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.7 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.13 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  37.2 
 
 		 327 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  37.2 
 
 		 327 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.04 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  36.71 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  34.47 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  37.42 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  38.2 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.96 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  35.75 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.12 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  35.41 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  35.58 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  35.75 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  30.2 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.12 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  38.06 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.64 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  38.41 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.11 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.32 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  34.78 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  36.23 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.12 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  29.63 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.1 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  34.04 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.38 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.88 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.16 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.02 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.43 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>