165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1518 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  460  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  51.27 
 
 
222 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  54.81 
 
 
223 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  54.81 
 
 
223 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  54.81 
 
 
223 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  50.88 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  53.27 
 
 
223 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  53.27 
 
 
223 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  49.78 
 
 
222 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  49.78 
 
 
222 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  49.58 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  50 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  54.76 
 
 
217 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  54.67 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  58.62 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  55.72 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  55.9 
 
 
219 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  55.38 
 
 
219 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  48.91 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  48.91 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  54.23 
 
 
219 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  51.98 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  48.88 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  52.48 
 
 
223 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  51.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  50.98 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  51.79 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003413  putative TEGT family carrier/transport protein  49.25 
 
 
220 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  54.36 
 
 
219 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02365  hypothetical protein  45.79 
 
 
220 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1308  hypothetical protein  52.68 
 
 
225 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  47.47 
 
 
222 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  44.29 
 
 
220 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1654  hypothetical protein  49.34 
 
 
222 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000000318402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1618  integral membrane protein  45.89 
 
 
217 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000193362  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1391  hypothetical protein  49.07 
 
 
226 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  44.3 
 
 
229 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  45.75 
 
 
219 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  45.28 
 
 
219 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  45.91 
 
 
219 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  47.96 
 
 
219 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  45.28 
 
 
219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  45.28 
 
 
219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1202  carrier/transport protein  45.41 
 
 
222 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  44.6 
 
 
219 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  42.92 
 
 
219 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  40.83 
 
 
220 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  42.92 
 
 
219 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  42.92 
 
 
219 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  44.04 
 
 
219 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  41.82 
 
 
219 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  44.44 
 
 
222 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  42.18 
 
 
219 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  42.47 
 
 
219 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  41.78 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2200  hypothetical protein  43.52 
 
 
219 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.581022  normal  0.150789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  46.08 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  41.71 
 
 
218 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  39.81 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  34.04 
 
 
226 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  32.89 
 
 
230 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1843  hypothetical protein  37.61 
 
 
201 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000008049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  32.03 
 
 
231 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  35.45 
 
 
230 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  37.38 
 
 
231 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  33.17 
 
 
233 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  32.69 
 
 
233 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  36.89 
 
 
231 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1257  hypothetical protein  32.47 
 
 
231 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0923659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  34.6 
 
 
233 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  31.51 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  31.51 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  31.51 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  31.51 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  34.82 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  34.82 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  31.05 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  39.43 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  31.05 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  33.81 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  31.05 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  31.05 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  35.41 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  32.37 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  34.12 
 
 
233 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>