158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1481 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
341 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  37.58 
 
 
327 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  37.58 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
330 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
328 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  38.39 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  37.38 
 
 
328 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
328 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  36.99 
 
 
328 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  36.68 
 
 
328 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  36.56 
 
 
328 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  33.33 
 
 
843 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
329 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
314 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  33.95 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  34.74 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
383 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
358 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
333 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  32.34 
 
 
344 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  33.13 
 
 
355 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  32.62 
 
 
332 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
367 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
360 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
368 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  31.27 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
339 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.05 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  28.88 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.03 
 
 
413 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  28.15 
 
 
337 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
323 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  30.3 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.52 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.22 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.59 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.03 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  27.42 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  23.98 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  27.08 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  27.66 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  26.95 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.63 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92705  predicted protein  26.15 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844655  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.58 
 
 
438 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  34.41 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  44.07 
 
 
460 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  28.14 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.94 
 
 
420 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  30.22 
 
 
493 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  23.32 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.71 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  35.71 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  35.71 
 
 
468 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  35.71 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  40 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  38.71 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  38.71 
 
 
485 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  38.71 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  38.71 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  37.5 
 
 
519 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  42.5 
 
 
494 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  38.71 
 
 
487 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  40 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  37.1 
 
 
487 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.23 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  35.9 
 
 
532 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  38.33 
 
 
487 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  38.71 
 
 
490 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
530 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  45.16 
 
 
507 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
516 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  37.88 
 
 
498 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  34.78 
 
 
353 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  23.06 
 
 
439 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04110  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01002)  25.54 
 
 
492 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1151  hypothetical protein  33.87 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  34.78 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>