17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1211 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1149    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  37.84 
 
 
545 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  37.84 
 
 
545 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  31.88 
 
 
559 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  29.63 
 
 
579 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  28.96 
 
 
538 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  35.88 
 
 
330 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  27.06 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  23.82 
 
 
633 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  24.65 
 
 
633 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  28.46 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  22.7 
 
 
595 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  22.7 
 
 
595 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  22.7 
 
 
595 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  26.67 
 
 
599 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5046  phage integrase family protein  23.17 
 
 
792 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  23.14 
 
 
602 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>