22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1203 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  748    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.2 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  26.79 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  26.45 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  28.24 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.35 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  27.35 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  27.35 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  27.67 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  26.5 
 
 
339 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  28.93 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  27.55 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.66 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 
270 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 
270 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.23 
 
 
339 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.66 
 
 
344 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  24.03 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  24.53 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>