More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1185 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  45.25 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  39.9 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  44.25 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  39.9 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  39.41 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  42.94 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  42.08 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  42.53 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  43.1 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  44.05 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  38.71 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  36.15 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  37.09 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  38.25 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  36.15 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  40.21 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  40.76 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  36.54 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  43.6 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  43.6 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  37.44 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  36.49 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  39.36 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  42.44 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  36.24 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  36.24 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  38.14 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  36.24 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.24 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  36.15 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  35.81 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  36.67 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.88 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  38.95 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.04 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  35.44 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  35.07 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  38.64 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  38.01 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  38.01 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  35.98 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  38.42 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  35.5 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  36.26 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  36.26 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  36.26 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  38.73 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  38.73 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  36.26 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  37.5 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  36.26 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  36.26 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  36.26 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  37.43 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  35.05 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  34.98 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  33.82 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  35.63 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  43.11 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  35.44 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  35.44 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  35.98 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  35.44 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  36.02 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  38.51 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  34.76 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.43 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  36.04 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  32.04 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.92 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>