84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1184 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  100 
 
 		 337 aa  711    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  48.82 
 
 		 313 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  47.56 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  42.28 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  46.56 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  40.56 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  40.56 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  42.96 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  40.97 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  37.46 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  42.31 
 
 		 352 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  45.78 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  38.59 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  41.52 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  41.61 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  37.57 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  40.28 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  39.5 
 
 		 291 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  40.56 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  45.93 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  38.51 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  37.4 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 269 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.57 
 
 		 675 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  40.16 
 
 		 675 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  42.52 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  39.26 
 
 		 698 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.18 
 
 		 689 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  41.78 
 
 		 721 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  41.78 
 
 		 721 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  41.78 
 
 		 694 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.13 
 
 		 699 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.55 
 
 		 726 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  36.3 
 
 		 773 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  42.06 
 
 		 669 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 728 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  40.65 
 
 		 708 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 712 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 691 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  37.39 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  35.09 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  34.55 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  33.86 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  37.61 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  37.66 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  35.45 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  35.81 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  31.85 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  34.5 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  35.81 
 
 		 671 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  33.19 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  41.88 
 
 		 139 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  46.15 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  49.37 
 
 		 125 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  31.72 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  25.96 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  26.87 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  26.87 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  47.22 
 
 		 79 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  26.87 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.89 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  29.46 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  29.41 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  32.58 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  26.38 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  26.13 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  25.5 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  28.81 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  29.9 
 
 		 211 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>