239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1035 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 499 aa  1032    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  55.02 
 
 		 492 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  55.07 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  54.87 
 
 		 495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  52.09 
 
 		 524 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  52.41 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  51.62 
 
 		 526 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  51.62 
 
 		 526 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  53.29 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  51.8 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  51.6 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  49.3 
 
 		 483 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  48.3 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  47.6 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  50.7 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  47.69 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  47.52 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  47.28 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  46.78 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.88 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  45.29 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  45.29 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  42.45 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  42.45 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  40.67 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.37 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  41.48 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.2 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  39.88 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  40.88 
 
 		 490 aa  359  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  39.96 
 
 		 489 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.8 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.56 
 
 		 316 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.53 
 
 		 316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.08 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.85 
 
 		 255 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  27.24 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.26 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.83 
 
 		 301 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.46 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.93 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.6 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  27.51 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.72 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.43 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  26.64 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.33 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  28.8 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  27.51 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.16 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25.52 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25.52 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.81 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.81 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.81 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.55 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.51 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  26.96 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.98 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  25.4 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.87 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.9 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.06 
 
 		 302 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  25.97 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  26.52 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  26.52 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  26.52 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  26.52 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  24.78 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.69 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.96 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.33 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  25.67 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.9 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25.75 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.76 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.9 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  25.59 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.59 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.59 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.59 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.4 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.4 
 
 		 327 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.2 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  24.02 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  21.82 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25.39 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.68 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.41 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  25.43 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  25.39 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.13 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>