123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0960 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  100 
 
 		 169 aa  350  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  34.15 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  32.37 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  33.58 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  32.37 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  32.37 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  31.33 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  32.37 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  32.85 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  28.91 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  30.99 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.52 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  28.78 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  30.94 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  28.79 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.01 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.16 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  25.69 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.71 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  30.22 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.14 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.55 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.94 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.4 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.37 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.36 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.11 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  30.83 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  29.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.81 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.46 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.46 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.46 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.97 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  27.69 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  34.27 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01577  DNA polymerase III chi subunit  26.96 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.167803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.6 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  25.17 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.37 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.6 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.6 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.12 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  29.23 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  28 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  26.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  26.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  26.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  27.05 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  32.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  32.76 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  32.2 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.03 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.03 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  24.58 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  30 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  31.03 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.55 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.17 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  31.25 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.01 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  32.39 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0561  DNA polymerase III subunit chi  28.44 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  29.57 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  30.51 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.62 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  29.91 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.78 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1378  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.47 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  24.48 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.78 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  26.72 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.3 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  30.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.57 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  26.23 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  27.87 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  26.61 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.12 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  31.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  29.79 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>