More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0679 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  50.19 
 
 		 773 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  48.14 
 
 		 759 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  49.28 
 
 		 773 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  50.06 
 
 		 773 aa  774    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  52.3 
 
 		 748 aa  740    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  45.72 
 
 		 830 aa  657    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  48.58 
 
 		 773 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  42.76 
 
 		 827 aa  642    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  49.81 
 
 		 773 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  49.55 
 
 		 774 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  49.6 
 
 		 778 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  44.89 
 
 		 881 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  47.4 
 
 		 732 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  45.98 
 
 		 777 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  42.89 
 
 		 827 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  53.12 
 
 		 775 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  52.06 
 
 		 780 aa  773    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  49.28 
 
 		 776 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  49.68 
 
 		 773 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  52.13 
 
 		 774 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  52.16 
 
 		 772 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 772 aa  1572    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  44.56 
 
 		 780 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  41.68 
 
 		 781 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  41.29 
 
 		 768 aa  585  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  42.18 
 
 		 764 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  40.36 
 
 		 766 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  41.09 
 
 		 779 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  41.63 
 
 		 764 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  41.63 
 
 		 764 aa  582  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  40.95 
 
 		 791 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  41.18 
 
 		 742 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  41.22 
 
 		 774 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  40.82 
 
 		 774 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  40.75 
 
 		 790 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  40.95 
 
 		 774 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  42.22 
 
 		 779 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  40.88 
 
 		 768 aa  569  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  41.39 
 
 		 790 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  43.15 
 
 		 790 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 787 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  43.24 
 
 		 796 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  39.95 
 
 		 789 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  42.11 
 
 		 777 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  42.64 
 
 		 814 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  44.19 
 
 		 791 aa  548  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  41.78 
 
 		 792 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 769 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  41.79 
 
 		 792 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  40.34 
 
 		 826 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  41.81 
 
 		 813 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  44.17 
 
 		 836 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  40.46 
 
 		 826 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  40.34 
 
 		 824 aa  535  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  40.86 
 
 		 827 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  43.27 
 
 		 826 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  40.1 
 
 		 826 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  42.13 
 
 		 833 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  40.38 
 
 		 730 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  39.84 
 
 		 754 aa  512  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  41.51 
 
 		 841 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  41.51 
 
 		 844 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  41.51 
 
 		 841 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  40.62 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  40.62 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  40.57 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  40.62 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  38.32 
 
 		 766 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  40.62 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  41.37 
 
 		 844 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  40.48 
 
 		 840 aa  499  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  41.37 
 
 		 844 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  41.37 
 
 		 844 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  41.37 
 
 		 844 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  41.23 
 
 		 844 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  40.94 
 
 		 840 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 757 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 		 766 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  31.45 
 
 		 890 aa  356  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  33.05 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  33.28 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 		 643 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  36.65 
 
 		 734 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  34.15 
 
 		 655 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.84 
 
 		 625 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  36.92 
 
 		 735 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.24 
 
 		 720 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.65 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.85 
 
 		 739 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.36 
 
 		 618 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 741 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 646 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.29 
 
 		 734 aa  301  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.95 
 
 		 683 aa  300  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.85 
 
 		 683 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 		 640 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 683 aa  299  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  35.97 
 
 		 732 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 683 aa  296  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 643 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>