More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0581 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
417 aa  835    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  50.14 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.91 
 
 
433 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.81 
 
 
422 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  48.25 
 
 
395 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  51.21 
 
 
394 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  47.33 
 
 
405 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  49.48 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.67 
 
 
442 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.87 
 
 
383 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  46.39 
 
 
395 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  46.39 
 
 
388 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.92 
 
 
399 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 
395 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  49.19 
 
 
400 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  47.8 
 
 
384 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.63 
 
 
394 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  47.8 
 
 
384 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.75 
 
 
397 aa  319  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  48.52 
 
 
423 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  48.13 
 
 
381 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  49.01 
 
 
383 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  48.07 
 
 
400 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.85 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  46.85 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  45.15 
 
 
409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  45.55 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  44.41 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  45.15 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  47.7 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  44.9 
 
 
409 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  44.9 
 
 
397 aa  312  9e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 
418 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  44.99 
 
 
386 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 
386 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  45.48 
 
 
386 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  50.76 
 
 
395 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.42 
 
 
403 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.68 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.66 
 
 
386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  46.35 
 
 
385 aa  305  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.48 
 
 
410 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.56 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  42.97 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  46.61 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  49.7 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  46.83 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  45.31 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.35 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  46.35 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  46.35 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.06 
 
 
412 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  46.35 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  46.87 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 
397 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.33 
 
 
411 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  46.09 
 
 
385 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.07 
 
 
398 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  46.09 
 
 
385 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  43.6 
 
 
386 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  50.27 
 
 
415 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  46.09 
 
 
385 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  46.77 
 
 
397 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  46.77 
 
 
397 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  46.93 
 
 
384 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  46.77 
 
 
397 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  46.36 
 
 
385 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  46.77 
 
 
397 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  46.36 
 
 
385 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.56 
 
 
397 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  46.77 
 
 
397 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  46.36 
 
 
385 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  43.8 
 
 
386 aa  300  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  46.86 
 
 
431 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  44.24 
 
 
401 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.17 
 
 
382 aa  299  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  44.39 
 
 
394 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.99 
 
 
383 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  44.95 
 
 
382 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.21 
 
 
379 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  44.95 
 
 
382 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  44.95 
 
 
382 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  46.09 
 
 
385 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  45.32 
 
 
353 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  44.95 
 
 
382 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  44.65 
 
 
381 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.65 
 
 
381 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  45.82 
 
 
420 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  46.49 
 
 
373 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.82 
 
 
420 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.82 
 
 
420 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  43.27 
 
 
379 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  45.82 
 
 
420 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>