87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0514 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 385 aa  793    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  32.1 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.07 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  28.39 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.34 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.93 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  25.72 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  27.42 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  23.8 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  23.8 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.37 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  24.05 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.31 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  28.69 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  21.95 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  30.04 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  24.8 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.14 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  24.89 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  29.39 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  36.19 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 191 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 229 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  29.67 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.67 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  30.59 
 
 		 568 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  22.85 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  21.67 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.76 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  21.62 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  44.83 
 
 		 232 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 130 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  34.69 
 
 		 578 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  23.64 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  42.03 
 
 		 960 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  22.61 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  43.4 
 
 		 779 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  41.94 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>