More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0503 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0503  patatin  100 
 
 
748 aa  1498    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  38.36 
 
 
745 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  38.16 
 
 
728 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  38.37 
 
 
733 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.24 
 
 
727 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  36.24 
 
 
751 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  36.03 
 
 
728 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.87 
 
 
728 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  34.04 
 
 
738 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  34.04 
 
 
738 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  34.67 
 
 
734 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.41 
 
 
728 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.11 
 
 
738 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.53 
 
 
735 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.06 
 
 
741 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.59 
 
 
728 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  33.24 
 
 
739 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  32.87 
 
 
738 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  32.48 
 
 
736 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  35.52 
 
 
750 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  32.09 
 
 
751 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.4 
 
 
738 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.4 
 
 
737 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  32.4 
 
 
738 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.62 
 
 
738 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.82 
 
 
754 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  34.78 
 
 
777 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  33.24 
 
 
737 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  32.4 
 
 
737 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.21 
 
 
767 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.22 
 
 
735 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  34.66 
 
 
753 aa  354  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  32.42 
 
 
771 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.97 
 
 
790 aa  342  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  32.97 
 
 
764 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  32.86 
 
 
776 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  32.75 
 
 
813 aa  334  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  33.2 
 
 
930 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  33.2 
 
 
920 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  33.93 
 
 
933 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  33.93 
 
 
945 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  33.93 
 
 
728 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  32.65 
 
 
852 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.66 
 
 
803 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.53 
 
 
803 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  33.52 
 
 
714 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  32.59 
 
 
745 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.53 
 
 
803 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.79 
 
 
804 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.64 
 
 
667 aa  316  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.36 
 
 
796 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.26 
 
 
798 aa  311  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  32.03 
 
 
729 aa  300  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.22 
 
 
733 aa  247  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.38 
 
 
720 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.55 
 
 
760 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26 
 
 
740 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.96 
 
 
740 aa  193  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.84 
 
 
746 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  38.82 
 
 
333 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  38.16 
 
 
320 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  38.16 
 
 
320 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  27.29 
 
 
775 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.71 
 
 
256 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.1 
 
 
263 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.7 
 
 
311 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.38 
 
 
320 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  35.94 
 
 
950 aa  152  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  32.11 
 
 
894 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  37.41 
 
 
260 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  39.7 
 
 
330 aa  151  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.84 
 
 
900 aa  151  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  33.53 
 
 
875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  36.3 
 
 
923 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.23 
 
 
273 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  36.57 
 
 
301 aa  147  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.65 
 
 
263 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.31 
 
 
263 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  39.33 
 
 
311 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.55 
 
 
275 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  37.23 
 
 
316 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.98 
 
 
263 aa  145  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.98 
 
 
263 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  41.71 
 
 
323 aa  145  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  34.04 
 
 
909 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.98 
 
 
263 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.98 
 
 
263 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.98 
 
 
263 aa  145  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.98 
 
 
263 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.64 
 
 
263 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.9 
 
 
275 aa  144  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.3 
 
 
263 aa  143  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.66 
 
 
707 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  42.18 
 
 
323 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  37.02 
 
 
298 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.88 
 
 
319 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.79 
 
 
253 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  37.12 
 
 
346 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  36.19 
 
 
327 aa  140  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  38.07 
 
 
315 aa  140  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>