More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0449 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  61.35 
 
 		 514 aa  681    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  64.12 
 
 		 542 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  60.24 
 
 		 595 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  69.29 
 
 		 526 aa  782    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  64.51 
 
 		 517 aa  693    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  66.15 
 
 		 519 aa  698    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  62.7 
 
 		 518 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  65.77 
 
 		 517 aa  692    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 520 aa  1079    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  59.04 
 
 		 516 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  55.45 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  54.67 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 526 aa  319  7e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 526 aa  312  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  35.15 
 
 		 528 aa  306  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  35.76 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 524 aa  297  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 538 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  34.32 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  35.52 
 
 		 527 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 528 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36.44 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 529 aa  280  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 532 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  34.46 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 523 aa  269  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 		 528 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 528 aa  266  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 526 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 526 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.59 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 530 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 533 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 		 533 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.87 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 556 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  32.03 
 
 		 527 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  29.37 
 
 		 528 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 512 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 520 aa  224  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.71 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 527 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 537 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 521 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 532 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.9 
 
 		 521 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  28.43 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.01 
 
 		 509 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 526 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 528 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  30.06 
 
 		 525 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.57 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 534 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 		 534 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.57 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.13 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.13 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.13 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.8 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 535 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.49 
 
 		 516 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.49 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>