95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0403 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  68.56 
 
 		 227 aa  292  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  65.61 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  40 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  39.33 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.33 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  39.66 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.76 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  40.22 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  38.2 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  39.33 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.56 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  38.12 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  36.87 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.55 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  36.04 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.57 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.29 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.96 
 
 		 178 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.05 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  26.04 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  26.04 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  26.04 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  26.04 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  29.61 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  24.85 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  30.9 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  29.67 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  30.87 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  26.97 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  28.03 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  25.44 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.46 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  27.85 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.94 
 
 		 1407 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.57 
 
 		 1390 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  28.03 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  25.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  27.39 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  27.39 
 
 		 281 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  26.75 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  26.75 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  26.75 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  26.75 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.7 
 
 		 1433 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  23.08 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  23.08 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  29.11 
 
 		 1362 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.96 
 
 		 595 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  29.05 
 
 		 603 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.32 
 
 		 565 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  26.8 
 
 		 1449 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  35.19 
 
 		 1367 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.16 
 
 		 1397 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  35.19 
 
 		 1367 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  28.09 
 
 		 1426 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.22 
 
 		 720 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  28.81 
 
 		 585 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  33.06 
 
 		 601 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  24.1 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.29 
 
 		 1449 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  26.62 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  28.5 
 
 		 584 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  27.01 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.66 
 
 		 470 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  23.59 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  29.12 
 
 		 578 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.94 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  28.42 
 
 		 273 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0549  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.07 
 
 		 342 aa  42  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.860226  hitchhiker  0.000115657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.26 
 
 		 934 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 934 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.8 
 
 		 570 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  27.93 
 
 		 578 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.56 
 
 		 610 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.56 
 
 		 952 aa  41.2  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>