More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0349 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  100 
 
 
523 aa  1054    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  37.07 
 
 
714 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.15 
 
 
663 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  33.6 
 
 
608 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32 
 
 
668 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.73 
 
 
668 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  31.48 
 
 
494 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  46.45 
 
 
646 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  42.23 
 
 
1079 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  45 
 
 
1099 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  31.22 
 
 
494 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  46.41 
 
 
563 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  43.48 
 
 
638 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  45.08 
 
 
355 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  38.1 
 
 
721 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  48.82 
 
 
501 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  45.25 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  42.78 
 
 
273 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  42.22 
 
 
565 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  42 
 
 
448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
510 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
510 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
510 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.22 
 
 
355 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1041  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
791 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4588  diguanylate cyclase  43.96 
 
 
613 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  45.41 
 
 
422 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
466 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  46.74 
 
 
530 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
398 aa  143  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1243  diguanylate cyclase  39.42 
 
 
419 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  44.89 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.5 
 
 
558 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  45.03 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.62 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  41.24 
 
 
320 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  47.2 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0984  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
489 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  44.19 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6347  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
507 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.197089 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0250  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
489 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0315  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
484 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0401  GGDEF domain-containing protein  46.47 
 
 
507 aa  140  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  44.05 
 
 
312 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0390  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.817676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1755  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1346  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0669442  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  43.48 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0097  GGDEF domain-containing protein  46.47 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
356 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2678  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1077  GGDEF domain-containing protein  46.47 
 
 
528 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1257  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0115  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.12 
 
 
353 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1535  diguanylate cyclase  46.47 
 
 
487 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
354 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  43.96 
 
 
457 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2825  GGDEF domain-containing protein  46.47 
 
 
487 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819973  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.35 
 
 
628 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230957  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03704  GGDEF domain protein  38.61 
 
 
325 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3188  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
529 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  39.9 
 
 
457 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  43.58 
 
 
461 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.4 
 
 
341 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  38.25 
 
 
490 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  45.4 
 
 
385 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  40 
 
 
355 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.12 
 
 
632 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.99 
 
 
550 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
356 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.41 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  45.93 
 
 
612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  41.58 
 
 
564 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  41.52 
 
 
578 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  44.51 
 
 
354 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  43.43 
 
 
498 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  40.1 
 
 
472 aa  136  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5454  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
510 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  36.68 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0518  diguanylate cyclase  43.1 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  38.89 
 
 
609 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  38.89 
 
 
709 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
681 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  39.47 
 
 
363 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1924  diguanylate cyclase  36.74 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.495061 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0715  diguanylate cyclase  40.83 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2619  diguanylate cyclase  36.99 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0930  diguanylate cyclase  35.87 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  40.94 
 
 
578 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  39.76 
 
 
583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.61 
 
 
359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3165  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624427  hitchhiker  0.00241131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  44.24 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  37.85 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  44.77 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>