67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0315 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  39.52 
 
 
143 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  44.23 
 
 
171 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  42.06 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  38.05 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  38.46 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  47.67 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  39.77 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  33.01 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  38.39 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  38.39 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  37.93 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  38.38 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  38.38 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  37.96 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  34.07 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  32.79 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.87 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  35.53 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  30.16 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  39.19 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.99 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  42.35 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  25.51 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  29.6 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  26.37 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  26.19 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  41.18 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  24.41 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  28.09 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  32.93 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  34.29 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  36.25 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  30 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  28.09 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  29.21 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  40.28 
 
 
97 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  31.63 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32.1 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  27.38 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  42.59 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  26.32 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  26.32 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  40.35 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  39.22 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  44.9 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  32.81 
 
 
293 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  41.86 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  44.9 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  28.43 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  44.9 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  44.9 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  45.24 
 
 
217 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  34.52 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  27.16 
 
 
112 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>