More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0269 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 
206 aa  184  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.33 
 
 
201 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  46.96 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  50 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  48.77 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  50.31 
 
 
194 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  43.65 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  46.63 
 
 
190 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  49.07 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  45.25 
 
 
195 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  48.77 
 
 
188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  44.21 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  44.72 
 
 
217 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  48.15 
 
 
188 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  48.77 
 
 
188 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  43.55 
 
 
189 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.12 
 
 
191 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
190 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.11 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  43.43 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
201 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 
235 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
203 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  34.38 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
239 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
239 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 
243 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
243 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
241 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.52 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.75 
 
 
213 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
240 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
411 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
213 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
240 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.93 
 
 
249 aa  99  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  30.43 
 
 
204 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
247 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
223 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.13 
 
 
378 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
226 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.86 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
363 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.94 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.58 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
240 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
155 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
440 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.41 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.77 
 
 
378 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.89 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
402 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
212 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.96 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.58 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.39 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.29 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.58 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>