58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0185 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0185  ferric siderophore transport system,innermembrane protein E  100 
 
 		 131 aa  264  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.224438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1852  biopolymer transport exbD protein  33.88 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 		 156 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  30.84 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.46 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.36 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  29.06 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.21 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.19 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.52 
 
 		 135 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  23.64 
 
 		 133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.64 
 
 		 133 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.09 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2278  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0502314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  29.69 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.89 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.83 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  29.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.99 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0886  ExbD/TolR family protein  27.73 
 
 		 135 aa  40  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.59 
 
 		 140 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.35 
 
 		 134 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.4 
 
 		 140 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.83 
 
 		 143 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 		 130 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>