257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0107 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  63.8 
 
 
215 aa  280  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  63.01 
 
 
212 aa  279  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  63.3 
 
 
210 aa  276  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  62.5 
 
 
210 aa  274  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  56.31 
 
 
218 aa  268  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  59.26 
 
 
210 aa  268  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  57.41 
 
 
210 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  57.41 
 
 
210 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  57.41 
 
 
210 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  59.72 
 
 
210 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  261  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  56.48 
 
 
210 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  61.75 
 
 
211 aa  260  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  56.48 
 
 
210 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  56.48 
 
 
210 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  62.04 
 
 
209 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  56.48 
 
 
210 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  56.48 
 
 
210 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  56.94 
 
 
210 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  57.41 
 
 
211 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  57.8 
 
 
212 aa  257  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  55.96 
 
 
212 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  57.14 
 
 
211 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  61.11 
 
 
210 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  58.8 
 
 
210 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  55.09 
 
 
210 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  56.02 
 
 
210 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  55.5 
 
 
212 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  56.22 
 
 
211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  61.47 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  61.47 
 
 
212 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  56.22 
 
 
211 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  59.53 
 
 
209 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  57.87 
 
 
210 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  56.48 
 
 
210 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  52.51 
 
 
216 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  53.91 
 
 
237 aa  246  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  59.63 
 
 
211 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  58.53 
 
 
211 aa  244  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  59.26 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  53.78 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  57.87 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  58.8 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  60.65 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  57.87 
 
 
210 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  59.26 
 
 
210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  57.08 
 
 
212 aa  238  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  58.33 
 
 
209 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  54.38 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  52.31 
 
 
210 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  55.5 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  55.3 
 
 
211 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  52.78 
 
 
210 aa  228  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  57.47 
 
 
212 aa  225  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  56.05 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  55.71 
 
 
216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  54.11 
 
 
198 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  56.94 
 
 
210 aa  208  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  52.47 
 
 
224 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  54.55 
 
 
222 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  41.74 
 
 
233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  38.74 
 
 
197 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  37.83 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  33.33 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  30.91 
 
 
193 aa  88.6  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32 
 
 
205 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 
195 aa  84.7  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.22 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.98 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  31.25 
 
 
209 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27.43 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  30.04 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  27.73 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  27.73 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  30.67 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  28.94 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  33.33 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  30.36 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  28.44 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  38.33 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  27.05 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  29.88 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>