40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0093 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
434 aa  875    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  47.07 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  45.23 
 
 
402 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  43.16 
 
 
427 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 
420 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  38.38 
 
 
388 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  24.19 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  24.35 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  24.05 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  27.25 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  27.52 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  24.19 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  23.28 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  23.15 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  23.75 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  22.85 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  24.2 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  22.85 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  23.6 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  26.97 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  27.5 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  26.34 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  25.64 
 
 
395 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  26.49 
 
 
411 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  25.79 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  26.77 
 
 
400 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  25.83 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  25.06 
 
 
403 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.01 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  24.19 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  26.88 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  24.15 
 
 
419 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  28.83 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  23.91 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  26.59 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  25.56 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  25.95 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.12 
 
 
371 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  24.63 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  31.51 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>