More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0080 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  970    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  43.47 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  38.76 
 
 
508 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  36.34 
 
 
468 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  34.22 
 
 
474 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  28.11 
 
 
462 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  27.02 
 
 
458 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  27.02 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  24.48 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  27.82 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  28.66 
 
 
461 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  28.57 
 
 
454 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  28.46 
 
 
462 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  28.51 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  28.51 
 
 
454 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  28.94 
 
 
454 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  25.48 
 
 
464 aa  87.4  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  32.2 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  26.96 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  26.42 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  26.35 
 
 
524 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  25.57 
 
 
538 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  25.35 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  27.53 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  28.31 
 
 
531 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  30.59 
 
 
463 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  27.81 
 
 
515 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  30 
 
 
496 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
495 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 
490 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  28.82 
 
 
493 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  31.93 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  28.24 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.05 
 
 
464 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  34.18 
 
 
488 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  25.86 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  25.9 
 
 
725 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  24.31 
 
 
324 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  43.06 
 
 
467 aa  54.3  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  38.89 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  29.41 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 
462 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  29.8 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  30 
 
 
458 aa  53.5  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 
441 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  27.81 
 
 
447 aa  53.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  39.19 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.51 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  40.28 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  40.28 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
487 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  40.85 
 
 
458 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  26.12 
 
 
442 aa  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  40.85 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
488 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  30 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  28.31 
 
 
479 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
498 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.62 
 
 
480 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
455 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  25.31 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  27.65 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  32.91 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  38.67 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  34.72 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 
493 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  30.52 
 
 
506 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  38.89 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
439 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
488 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
449 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  26.04 
 
 
709 aa  50.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
449 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>