240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0074 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  100 
 
 
292 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  36.01 
 
 
312 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  30.6 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.17 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  29.21 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.76 
 
 
307 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  33.22 
 
 
310 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.83 
 
 
302 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.65 
 
 
331 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.37 
 
 
351 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.91 
 
 
327 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.58 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  30.23 
 
 
345 aa  96.7  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  30.51 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.78 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  28.68 
 
 
350 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.36 
 
 
320 aa  89  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.11 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  27.73 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  27.87 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.27 
 
 
339 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  29.03 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.69 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  28 
 
 
348 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.91 
 
 
332 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.23 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  28.52 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.73 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.76 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.47 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.72 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  28.52 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  25.91 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.12 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.35 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.82 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.63 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.63 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  25.94 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  24.81 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  26.32 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.68 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  27.34 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  27.06 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  27.13 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  28.57 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  26.74 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  26.32 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.55 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.76 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  27.71 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  28.22 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  29.37 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.69 
 
 
349 aa  79  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  28.24 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.48 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  25 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  29.1 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  24.9 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  27.49 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  29.57 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.76 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  28.78 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.52 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.29 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.52 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.13 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  26.54 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  24.03 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  25.3 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  24.52 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.6 
 
 
362 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  28.23 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.91 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.34 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  29.68 
 
 
505 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.57 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  25.4 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  30.4 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.71 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.03 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.1 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.52 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.24 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  27.91 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  27.91 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  27.91 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  26.36 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.31 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  30 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  29.07 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.24 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.72 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.46 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.44 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.83 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.9 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  25.98 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.81 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  27.86 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>