More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0070 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
306 aa  603  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  65.35 
 
 
303 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  71.23 
 
 
296 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  72.07 
 
 
297 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  68.28 
 
 
304 aa  361  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  68.28 
 
 
304 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 
299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  72.16 
 
 
297 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  73.51 
 
 
297 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  72.39 
 
 
297 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  59.87 
 
 
305 aa  342  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  60.48 
 
 
302 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  57.14 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  67.24 
 
 
299 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  56.54 
 
 
299 aa  331  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  61.05 
 
 
312 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  56.25 
 
 
301 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  58.5 
 
 
302 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  59.4 
 
 
301 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  56.04 
 
 
301 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  57.73 
 
 
305 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  57.73 
 
 
305 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  58.39 
 
 
300 aa  322  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  56.76 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  58.87 
 
 
317 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  58.94 
 
 
305 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  55.78 
 
 
313 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  55.78 
 
 
313 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  56.71 
 
 
300 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  53.82 
 
 
297 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  56.71 
 
 
300 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 
301 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  56.71 
 
 
300 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  57.09 
 
 
301 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 
300 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 
300 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  63.25 
 
 
294 aa  314  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  53.49 
 
 
297 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  56 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  56.63 
 
 
301 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  55.4 
 
 
298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  54.46 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  62.9 
 
 
294 aa  311  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  60.85 
 
 
302 aa  311  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  56.99 
 
 
300 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  56.63 
 
 
300 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  56.63 
 
 
300 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  56.63 
 
 
300 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  57.89 
 
 
304 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  55.63 
 
 
298 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 
300 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  56.99 
 
 
300 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  57.09 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  56.36 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  55.91 
 
 
300 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  53.44 
 
 
311 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  51.01 
 
 
301 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 
306 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  54.3 
 
 
299 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 
306 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  52.26 
 
 
301 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  54.45 
 
 
311 aa  295  9e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  59.15 
 
 
298 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  56.9 
 
 
301 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  56.9 
 
 
301 aa  289  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  57.58 
 
 
299 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  55.94 
 
 
300 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  53.64 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  52.82 
 
 
298 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
302 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 
304 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  54.09 
 
 
298 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  51.41 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  52.2 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  51.41 
 
 
306 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 
535 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  47.16 
 
 
534 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 
302 aa  236  3e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.11 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 
328 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 
295 aa  228  8e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  45.39 
 
 
296 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 
312 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.92 
 
 
624 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>