75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0068 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0068  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0186  hypothetical protein  38.61 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01350  hypothetical protein  38.92 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0073  hypothetical protein  35.75 
 
 
188 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.516477  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0128  hypothetical protein  35.57 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0123  hypothetical protein  35.05 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242172  normal  0.0223002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0108  hypothetical protein  34.31 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985875  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0125  hypothetical protein  34.31 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00960  hypothetical protein  34.63 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0148  hypothetical protein  30.93 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0268  hypothetical protein  30.23 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2850  hypothetical protein  30.88 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.210738  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0132  hypothetical protein  37.65 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.244121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  31.37 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0333  transmembrane protein  34.03 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.641985  normal  0.0102497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0321  transmembrane protein  29.63 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0317  hypothetical protein  34.67 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2839  hypothetical protein  30.15 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2226  hypothetical protein  30.15 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  30.15 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  31.4 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3175  hypothetical protein  30.53 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189685  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0231  hypothetical protein  29.15 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0042  hypothetical protein  28.5 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0511047  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3041  hypothetical protein  29.88 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001451  hypothetical protein in Cytochrome oxidase biogenesis cluster  31.86 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0226  putative transmembrane protein  28.37 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0245  hypothetical protein  28.84 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4240  hypothetical protein  29 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1687  hypothetical protein  30.63 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0370  hypothetical protein  27.59 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.176513  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06266  hypothetical protein  28.36 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04026  hypothetical protein  29.47 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  29.74 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0552  hypothetical protein  27.55 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.28845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0885  hypothetical protein  31.33 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44111  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0284  hypothetical protein  29.15 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0433  hypothetical protein  29.21 
 
 
249 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0162  hypothetical protein  28.14 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1430  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0299  putative transmembrane protein  30.85 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4612  hypothetical protein  26.96 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3190  hypothetical protein  28.14 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2857  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4164  hypothetical protein  28 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1682  hypothetical protein  31.1 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0680  Sco1  27.64 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.235059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0515  hypothetical protein  27.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0497  hypothetical protein  27.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3870  hypothetical protein  28.08 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3996  hypothetical protein  28.08 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1252  hypothetical protein  27.06 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3787  hypothetical protein  25.49 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3797  hypothetical protein  28.08 
 
 
181 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4004  hypothetical protein  28.86 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3004  hypothetical protein  30.54 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04007  hypothetical protein  26.94 
 
 
167 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4118  hypothetical protein  27.94 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0149  hypothetical protein  27.94 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0190  putative transmembrane protein  29.02 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4186  hypothetical protein  27.45 
 
 
181 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0252  hypothetical protein  25.82 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4317  hypothetical protein  26.47 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0119  hypothetical protein  28.26 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1386  hypothetical protein  31.86 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.027164  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3489  hypothetical protein  28.65 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0192  hypothetical protein  26.37 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1464  transmembrane protein  26.67 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0172  hypothetical protein  28.04 
 
 
181 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3522  hypothetical protein  27.96 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3826  hypothetical protein  24.42 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.422395 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1933  putative transmembrane protein  28.3 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1638  putative transmembrane protein  26.32 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.211067  normal  0.707062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3901  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116245  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4384  hypothetical protein  26.17 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>