23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0032 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0032  S-type pyocin domain-containing protein  100 
 
 
546 aa  1115    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  30.53 
 
 
859 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  33.61 
 
 
415 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  33.2 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1561  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  40 
 
 
195 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0986052  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  39.13 
 
 
1131 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  39.13 
 
 
1131 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0423  ribonuclease Ba  38.78 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0487  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  38.78 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1172  ribonuclease Ba  38.78 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0133135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4389  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  41.41 
 
 
149 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  28.52 
 
 
593 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2616  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.23 
 
 
176 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1233  hypothetical protein  28.02 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0876385  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2282  hypothetical protein  28.24 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09790  ribonuclease  33.05 
 
 
210 aa  73.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.530418 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0239  S-layer-like domain-containing protein  38.95 
 
 
168 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  30.49 
 
 
669 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2040  hypothetical protein  69.44 
 
 
36 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147506  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1483  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  36.84 
 
 
157 aa  58.9  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  24.66 
 
 
510 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  24.66 
 
 
510 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  25.68 
 
 
512 aa  51.6  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>