More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0015 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  47.5 
 
 		 757 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  48.07 
 
 		 754 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  43.65 
 
 		 855 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  48.8 
 
 		 762 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  47.54 
 
 		 785 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  47.71 
 
 		 766 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  48.34 
 
 		 761 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  48.34 
 
 		 753 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  48.34 
 
 		 775 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  50.33 
 
 		 755 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  49.48 
 
 		 779 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  50.13 
 
 		 746 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  50.8 
 
 		 772 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  47.32 
 
 		 766 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  48.1 
 
 		 766 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  50.07 
 
 		 745 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  48.56 
 
 		 788 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  48.9 
 
 		 801 aa  715    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  48.34 
 
 		 754 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  49.14 
 
 		 773 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  47.84 
 
 		 766 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  51.66 
 
 		 758 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  51.26 
 
 		 766 aa  730    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  47.71 
 
 		 766 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  51.8 
 
 		 758 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  47.84 
 
 		 766 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  48.67 
 
 		 753 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  47.61 
 
 		 753 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  49 
 
 		 756 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 750 aa  1540    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  46.88 
 
 		 798 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  49.54 
 
 		 773 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  50.33 
 
 		 755 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  51.05 
 
 		 773 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  43.36 
 
 		 855 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  46.74 
 
 		 790 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  50.1 
 
 		 495 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  33.2 
 
 		 774 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  31.8 
 
 		 790 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  49.07 
 
 		 431 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  31.5 
 
 		 781 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  31.24 
 
 		 781 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  31.59 
 
 		 785 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  29.53 
 
 		 777 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 852 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 807 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  29.61 
 
 		 798 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  31.03 
 
 		 798 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  27.77 
 
 		 797 aa  231  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  35.57 
 
 		 874 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  26.67 
 
 		 669 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25.42 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  25.11 
 
 		 670 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  24.62 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.84 
 
 		 619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  25.04 
 
 		 654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  27.59 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 617 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 574 aa  107  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 588 aa  100  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  22.88 
 
 		 550 aa  90.5  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  29.96 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 580 aa  88.6  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.57 
 
 		 739 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  24.65 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  28.06 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  23.73 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.19 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  27.1 
 
 		 722 aa  81.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  26.12 
 
 		 790 aa  81.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  22.33 
 
 		 835 aa  80.1  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  28.7 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  26.03 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  25 
 
 		 676 aa  72  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.44 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.55 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  26.93 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.63 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.47 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.84 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  25.06 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.78 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  22.21 
 
 		 938 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.31 
 
 		 721 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.9 
 
 		 934 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.07 
 
 		 725 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  28.03 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 934 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.97 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  21 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.91 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  22.58 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  24.36 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.5 
 
 		 909 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>