194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1257 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  66.16 
 
 		 268 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  65.4 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  66.02 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  64.09 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.68 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  32.44 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  35.37 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  30.8 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  32.52 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  31.54 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  30.8 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  30.86 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  32.81 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.93 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.37 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  32.11 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  27.97 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.76 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.44 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.54 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.39 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  27.46 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  31.64 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.19 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.08 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.59 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  26.39 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  29.62 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  26.2 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  29.31 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  29.05 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  29.73 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  27.32 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.7 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.52 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  27.73 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  23.88 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  26.49 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.64 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  28.06 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.38 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.31 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  25.91 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.89 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  26.36 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  21.7 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.19 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  31.31 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  25.58 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  25.67 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.27 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.47 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.25 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.77 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3316  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.05 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  23.61 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1297  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.96 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.75 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.55 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  27.31 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  28.02 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.15 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.05 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  25.12 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  24.5 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1485  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.83 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.76 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  21.51 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.91 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.28 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0649  xylose isomerase domain-containing protein  30.85 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000488201  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  21.72 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.72 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  21.72 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.5 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.29 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  21.72 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  21.72 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.75 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  21.72 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.22 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  23.74 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  28.64 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.82 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1496  xylose isomerase domain-containing protein  25.69 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00334669  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  23.53 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  21.31 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  21.31 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.02 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.44 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  24.9 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>