More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1046 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 429 aa  891    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  52.57 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  48.24 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  44.74 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  45.74 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  47.07 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  42.89 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  43.84 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  43.03 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  43.47 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  40.36 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  39.49 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  37.24 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  37.9 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  37.86 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  35.75 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  35.8 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  37.16 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  36.8 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  38.85 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  34.78 
 
 		 420 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  36.72 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  36.43 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  37.03 
 
 		 427 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  36.32 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  38.36 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  38.44 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  36 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  36.23 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 427 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  36.02 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  35.32 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  35.94 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  36 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  34.62 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  36.22 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  33.82 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  35.63 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  34.56 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  35.71 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  35.64 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  34.05 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  37.87 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  35.68 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  35.95 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  34.84 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  36.91 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  34.13 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  37.9 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  35.31 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  36.14 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  36.12 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  37.09 
 
 		 413 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  35.71 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  35.29 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  34.37 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  37.04 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  36.27 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  34.11 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  36.68 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  35.97 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  36.14 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  33.85 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  35.46 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  37.15 
 
 		 412 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  34.82 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  35.88 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  35.42 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  35.42 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  35.42 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  34.81 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  35.59 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  34.94 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  35.24 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  35.37 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  36.67 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  34.99 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.27 
 
 		 566 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  35.88 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  35.88 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  35.75 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  34.25 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  32.59 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  35.93 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  34.13 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  34.56 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  35.24 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  34.7 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  35.68 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  34.94 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  35.52 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  37.1 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  33.73 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>