More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1020 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1020  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0768  hydrogenase accessory protein HypB  75.46 
 
 
224 aa  333  9e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0055  hydrogenase accessory protein HypB  75 
 
 
224 aa  332  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1150  hydrogenase accessory protein HypB  74.54 
 
 
224 aa  331  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.922491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0833  hydrogenase accessory protein HypB  76.39 
 
 
227 aa  323  1e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  53.77 
 
 
222 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1515  hypothetical protein  48.57 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 
215 aa  191  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2308  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 
215 aa  191  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  46.76 
 
 
215 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2335  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 
297 aa  175  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  37.25 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  42.31 
 
 
293 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  41.9 
 
 
307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 
301 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 
286 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  38.24 
 
 
225 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 
269 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  42.03 
 
 
270 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 
276 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  43.14 
 
 
268 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 
215 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 
294 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  40.58 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 
270 aa  165  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  40.58 
 
 
267 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  38.05 
 
 
326 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  40.58 
 
 
266 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 
220 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  41.18 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  40.85 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  37.91 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  34.95 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1089  hydrogenase accessory protein HypB  38.73 
 
 
220 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 
253 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 
283 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  38.1 
 
 
268 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  38.99 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  35.58 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  39.81 
 
 
322 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  40.29 
 
 
264 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  41.55 
 
 
264 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  35.91 
 
 
224 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  42.23 
 
 
312 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  39.6 
 
 
266 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  38.24 
 
 
268 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  38.28 
 
 
250 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  40.38 
 
 
321 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  41.26 
 
 
275 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  35.75 
 
 
226 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 
253 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  36.97 
 
 
242 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  39.91 
 
 
279 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 
260 aa  158  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  34.15 
 
 
224 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  42.29 
 
 
253 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  40.98 
 
 
252 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  40.49 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  44.31 
 
 
248 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  42.29 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  35.19 
 
 
230 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  35.35 
 
 
352 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  38.65 
 
 
270 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  40 
 
 
244 aa  156  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  39.13 
 
 
277 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  35.68 
 
 
313 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  39.81 
 
 
252 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  42.63 
 
 
261 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  35.55 
 
 
234 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  40.59 
 
 
244 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  36.06 
 
 
219 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  34.91 
 
 
218 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  37.2 
 
 
227 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  42.63 
 
 
261 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  42.11 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1166  hydrogenase accessory protein HypB  41.43 
 
 
318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.153393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  41.79 
 
 
264 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 
281 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  42.16 
 
 
277 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  35.24 
 
 
235 aa  154  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1174  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 
312 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150463  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  33.65 
 
 
218 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  37.2 
 
 
253 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  37.38 
 
 
303 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  39.51 
 
 
239 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.86 
 
 
290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  37.07 
 
 
283 aa  153  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  38.83 
 
 
306 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.86 
 
 
290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  38.57 
 
 
254 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.86 
 
 
290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  37.93 
 
 
292 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  39.05 
 
 
263 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.86 
 
 
290 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  39.6 
 
 
254 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  39.35 
 
 
300 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.32 
 
 
303 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  39.02 
 
 
268 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>