55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0941 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0941  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  408  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.353676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2458  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.12 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2620  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.98 
 
 
214 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.195312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2556  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.75 
 
 
213 aa  104  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0373  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.47 
 
 
212 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0256597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1071  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.75 
 
 
213 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  9.47177e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0338  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.98 
 
 
213 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3190  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.22 
 
 
213 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2599  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.14 
 
 
213 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0741  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.66 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0890  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  35.94 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.973916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3798  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173142  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3715  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3783  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.61 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0555648  normal  0.797729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3657  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.53 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2462  hydrogenase 4 membrane component (E)  25 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4669  hydrogenase 4 subunit E  25.24 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.253819  normal  0.171348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3290  hydrogenase 4 membrane component  27.7 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0327  hypothetical protein  22.68 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704563  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0701  hydrogenase 4 membrane component (E)  27.57 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.202504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1615  putative hydrogenase, membrane subunit  24.19 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1530  putative hydrogenase, membrane subunit  24.19 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1319  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  30.32 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1039  hydrogenase 4 membrane subunit  29.11 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000344071  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0109  hydrogenase 4 membrane component  24.19 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1263  hypothetical protein  24.19 
 
 
219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.14188  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1305  hydrogenase 4 membrane component (E)  28 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0918  hydrogenase 4 membrane component  26 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1912  hydrogenase 4 membrane subunit  28.47 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.199181  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0177  hypothetical protein  24.47 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6067  hypothetical protein  24.06 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  hitchhiker  0.000527865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10086  hydrogenase hycP  23.08 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1451  hydrogenase subunit  31.21 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1125  hydrogenase-4 component E  30.33 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.457842  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_002936  DET1573  hydrogenase subunit, putative  31.61 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1689  hydrogenase, membrane subunit 2-like protein  24.37 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.674662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2189  hydrogenase 4 membrane subunit  22.37 
 
 
216 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2476  hypothetical protein  22.51 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1820  hypothetical protein  26.4 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000203651  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0793  hypothetical protein  28.21 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0129  hydrogenase 4 membrane subunit  27.01 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0545856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1792  hydrogenase 4 membrane component (E)  26.73 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.244901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1262  hypothetical protein  24.03 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3853  hypothetical protein  24.03 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.395736  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3432  NADH dehydrogenase (quinone)  31.88 
 
 
193 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326498  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3215  hypothetical protein  31.88 
 
 
193 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1864  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  26.28 
 
 
215 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.31142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2987  hypothetical protein  26.71 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0295877  hitchhiker  0.00167925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0776  NAD-dependent dehydrogenase subunit  23.28 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0168  putative hydrogenase-4 component E  21.92 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4286  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00379585  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2151  hydrogenase-4, E subunit  28.57 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1809  hydrogenase 4 membrane component  28.57 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0186  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  24.84 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1398  hydrogenase 4 membrane component (E)-like protein  21.83 
 
 
229 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>