58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0806 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
252 aa  510  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  75 
 
 
252 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  75 
 
 
252 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  73.81 
 
 
252 aa  361  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  73.41 
 
 
252 aa  360  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  49.21 
 
 
278 aa  237  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  47.81 
 
 
250 aa  235  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  50.98 
 
 
278 aa  232  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  48.62 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  48.21 
 
 
248 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 
247 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  47.41 
 
 
250 aa  228  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  49.6 
 
 
284 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  49.61 
 
 
285 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  49.02 
 
 
281 aa  223  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  45.28 
 
 
251 aa  221  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  46.22 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  47.41 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  48.19 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.85 
 
 
267 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  45.63 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  47.39 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  47.79 
 
 
247 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  46.8 
 
 
253 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  45.82 
 
 
263 aa  201  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  44.84 
 
 
249 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  39.68 
 
 
254 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  44.36 
 
 
271 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  37.5 
 
 
387 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  39.92 
 
 
363 aa  149  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  33.99 
 
 
397 aa  141  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  36.72 
 
 
363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  34.6 
 
 
372 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  28.52 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  27.13 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  27.2 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  25.67 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  25.67 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  25.57 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  27.1 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  27.66 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  31.03 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  27.23 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  27.48 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  27.48 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  27.23 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  27.1 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  27.13 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  26.05 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  25 
 
 
206 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>