More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0805 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
86 aa  166  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  77.91 
 
 
86 aa  141  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  77.91 
 
 
86 aa  140  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  77.91 
 
 
86 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  76.74 
 
 
86 aa  139  1e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  52.38 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  48.24 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.35 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  52.38 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  56.79 
 
 
87 aa  82.8  1e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 
81 aa  78.2  4e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  40.74 
 
 
84 aa  77  8e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  44.44 
 
 
84 aa  76.3  1e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 
82 aa  75.5  2e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 
81 aa  74.7  4e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 
81 aa  74.3  5e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 
81 aa  73.2  1e-12  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  46.34 
 
 
153 aa  72.4  2e-12  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  41.25 
 
 
82 aa  72.4  2e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  48.15 
 
 
81 aa  70.9  6e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  41.77 
 
 
83 aa  70.5  7e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  40.96 
 
 
85 aa  70.1  1e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  41.18 
 
 
87 aa  68.6  3e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 
82 aa  63.9  7e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 
82 aa  63.5  8e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.14 
 
 
98 aa  61.6  4e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 
82 aa  60.8  6e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
99 aa  60.5  8e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  1.56644e-07  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.15 
 
 
95 aa  60.5  8e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  41.43 
 
 
95 aa  60.1  9e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  36.47 
 
 
86 aa  59.7  1e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  53.12 
 
 
98 aa  60.1  1e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 
82 aa  59.7  1e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.37619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  53.12 
 
 
95 aa  59.3  2e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.56 
 
 
98 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  53.12 
 
 
98 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  45.24 
 
 
100 aa  58.9  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  45.24 
 
 
100 aa  58.9  2e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 
99 aa  58.9  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.56 
 
 
98 aa  59.3  2e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  58.5  3e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  51.56 
 
 
98 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  51.56 
 
 
103 aa  58.2  3e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
98 aa  58.2  3e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.23 
 
 
94 aa  58.5  3e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  42.35 
 
 
94 aa  57.8  5e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 
99 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
99 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
102 aa  57  8e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  1.15816e-05 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
95 aa  56.6  1e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
99 aa  56.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  40.3 
 
 
99 aa  55.5  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 
102 aa  56.2  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 
98 aa  55.8  2e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  55.5  2e-07  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
100 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 
102 aa  55.5  3e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.402e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.72317e-09  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 
110 aa  54.7  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 
105 aa  54.7  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.21122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  36.71 
 
 
82 aa  55.1  4e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  54.7  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
99 aa  54.3  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 
100 aa  54.7  5e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.67938e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  52.83 
 
 
99 aa  54.3  6e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  39.34 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  43.02 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
99 aa  53.9  7e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 
98 aa  53.5  8e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  44.78 
 
 
97 aa  53.5  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  44.78 
 
 
97 aa  53.5  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 
97 aa  52.8  1e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  53.1  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  1.01961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  46.27 
 
 
97 aa  52.8  1e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  37.7 
 
 
100 aa  53.1  1e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
95 aa  53.1  1e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 
101 aa  53.1  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  53.1  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.60172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
95 aa  53.1  1e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  37.7 
 
 
100 aa  52.8  1e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  41.43 
 
 
97 aa  53.1  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 
100 aa  53.1  1e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.18373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  41.18 
 
 
98 aa  53.1  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 
96 aa  53.1  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 
100 aa  52  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.0861e-06  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 
100 aa  52  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.47098e-06  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  45.61 
 
 
94 aa  52.4  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 
100 aa  52  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.25733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  43.55 
 
 
97 aa  52.4  2e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 
96 aa  52.4  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 
100 aa  52  2e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.49996e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>