More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0759 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  86.41 
 
 		 221 aa  380  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  85.92 
 
 		 221 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  84.21 
 
 		 220 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  81.78 
 
 		 221 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  53.23 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  54.84 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 206 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  52.66 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  55.37 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  52.08 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  54.1 
 
 		 263 aa  215  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  53.55 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  54.1 
 
 		 269 aa  215  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  51.04 
 
 		 199 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  49.47 
 
 		 202 aa  215  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  51.04 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  50.79 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  52.2 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  50.54 
 
 		 202 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  46.28 
 
 		 214 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  42.19 
 
 		 208 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  42.71 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  42.46 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  40.8 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  41.52 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  36.46 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  40.34 
 
 		 293 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  38.01 
 
 		 261 aa  144  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.59 
 
 		 290 aa  138  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  27.85 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  26.07 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  25.64 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  23.21 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  26.85 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  23.48 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  23.91 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3517  ribosomal protein S2  24.11 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  23.63 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  24.14 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  26.09 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  25.93 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  22.67 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  25.69 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  23.73 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  24.78 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  22.52 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  22.13 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  23.21 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  23.39 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  23.87 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  22.6 
 
 		 421 aa  58.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  24.11 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  27.19 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  24.44 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  23.32 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  24.65 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12270  SSU ribosomal protein S2P  23.21 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000736157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  24.31 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  24.31 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  26.91 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  24.14 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  23.85 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  22.32 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  24.56 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>