49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0741 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  100 
 
 		 464 aa  923    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  54.13 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  53.45 
 
 		 438 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  53.06 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  52.69 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  60.28 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  50.59 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  57.3 
 
 		 475 aa  332  9e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  58.52 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  57.41 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  57.56 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  57.52 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  56.02 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  54.93 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  55.97 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  51.93 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  53.64 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  55.22 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  55.6 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  55.56 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  54.41 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  54.48 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  54.02 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  51.53 
 
 		 461 aa  287  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  44.73 
 
 		 537 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  52.79 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  50.92 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  36.81 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.71 
 
 		 588 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  29.03 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  33.8 
 
 		 595 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  27.33 
 
 		 573 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  39.39 
 
 		 653 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  34.34 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39.39 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  31.31 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  30.1 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  38.16 
 
 		 660 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.72 
 
 		 640 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  29.17 
 
 		 705 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  31.16 
 
 		 598 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  37.18 
 
 		 189 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  31.43 
 
 		 580 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  44.44 
 
 		 604 aa  43.9  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  28.32 
 
 		 641 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  30 
 
 		 587 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  30.17 
 
 		 704 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  37.35 
 
 		 666 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  30.16 
 
 		 598 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>