19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0562 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  100 
 
 
437 aa  837    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  41.88 
 
 
444 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  38.17 
 
 
447 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  38.17 
 
 
447 aa  279  8e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  37.5 
 
 
447 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  53.52 
 
 
976 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  45.33 
 
 
535 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  38.38 
 
 
531 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  42.65 
 
 
1336 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  42.67 
 
 
532 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  41.67 
 
 
718 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0527  S-layer protein  23.27 
 
 
558 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  34.68 
 
 
312 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  37.04 
 
 
712 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  44.62 
 
 
754 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  38.03 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1255  S-layer protein  24.93 
 
 
562 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5103  hypothetical protein  26.21 
 
 
251 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1381  S-layer protein  24.37 
 
 
562 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0772806  normal  0.544245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>