More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0428 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 343 aa  688    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  65.14 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.8 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.53 
 
 		 332 aa  338  7e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.94 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.66 
 
 		 341 aa  316  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.17 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.67 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.94 
 
 		 404 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.51 
 
 		 341 aa  298  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.88 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.74 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.51 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  43.88 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.9 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.29 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.06 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.29 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.61 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.61 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  45.36 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.15 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.33 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  44.33 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  43.99 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  43.3 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.67 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  45.7 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  43.53 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.99 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  45.36 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.89 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.3 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.67 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.96 
 
 		 332 aa  255  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.6 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.76 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  45.02 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.49 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  41.14 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.58 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  44.67 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.77 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.86 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  44.67 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.55 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  38.76 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.89 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.05 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.52 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.57 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  39.35 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.83 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.37 
 
 		 614 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.7 
 
 		 607 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.98 
 
 		 613 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.18 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.66 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.15 
 
 		 614 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.86 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.69 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.09 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.42 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.6 
 
 		 643 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.98 
 
 		 344 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.54 
 
 		 635 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.82 
 
 		 350 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.05 
 
 		 680 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.45 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.51 
 
 		 629 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  45.61 
 
 		 615 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.41 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.87 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.36 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.88 
 
 		 628 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.22 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  37.39 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  44.25 
 
 		 635 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.49 
 
 		 638 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.62 
 
 		 604 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.99 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.07 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.18 
 
 		 650 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.45 
 
 		 603 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.52 
 
 		 646 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.07 
 
 		 648 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.29 
 
 		 617 aa  232  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.69 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.55 
 
 		 644 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.72 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.86 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>