More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0245 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.68 
 
 
539 aa  729    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.95 
 
 
539 aa  712    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.18 
 
 
546 aa  711    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.81 
 
 
539 aa  728    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
552 aa  1121    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.35 
 
 
540 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.03 
 
 
543 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  46.46 
 
 
542 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  46.34 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.57 
 
 
562 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.44 
 
 
589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  41.2 
 
 
576 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.93 
 
 
570 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  41.57 
 
 
584 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  43.11 
 
 
582 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.59 
 
 
608 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  39.04 
 
 
568 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.35 
 
 
638 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  37.77 
 
 
576 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.83 
 
 
626 aa  360  4e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  37.19 
 
 
575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  37.41 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  37.72 
 
 
598 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  37.3 
 
 
574 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  40.22 
 
 
609 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.44 
 
 
648 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
648 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
648 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.21 
 
 
627 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 
646 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.06 
 
 
644 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.26 
 
 
542 aa  345  8.999999999999999e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.71 
 
 
579 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.53 
 
 
623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  37.72 
 
 
646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.17 
 
 
579 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.84 
 
 
612 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.69 
 
 
644 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  37.65 
 
 
641 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.92 
 
 
621 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  38.47 
 
 
633 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.71 
 
 
637 aa  333  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.77 
 
 
598 aa  333  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.36 
 
 
568 aa  331  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.63 
 
 
637 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.07 
 
 
643 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.66 
 
 
575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  35.78 
 
 
596 aa  329  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.65 
 
 
578 aa  329  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.71 
 
 
575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.71 
 
 
575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.22 
 
 
566 aa  327  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.02 
 
 
646 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.31 
 
 
566 aa  323  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3147  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.75 
 
 
587 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3884  L-aspartate oxidase  35.75 
 
 
587 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.207594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.96 
 
 
606 aa  323  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 
575 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 
575 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 
599 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  36.95 
 
 
598 aa  320  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.06 
 
 
610 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.5 
 
 
603 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2079  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.51 
 
 
621 aa  317  4e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.59 
 
 
579 aa  317  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
681 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2832  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.55 
 
 
609 aa  316  8e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0155951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.96 
 
 
576 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.55 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.47 
 
 
567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.17 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3969  L-aspartate oxidase  35.04 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.06 
 
 
532 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1990  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.22 
 
 
609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.902859  normal  0.104925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  36.54 
 
 
570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  37.5 
 
 
567 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  34.37 
 
 
573 aa  313  5.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
602 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.69 
 
 
617 aa  312  9e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.99 
 
 
605 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.12 
 
 
585 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.46 
 
 
598 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.59 
 
 
581 aa  312  1e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.98 
 
 
598 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.22 
 
 
598 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.19 
 
 
590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.16 
 
 
582 aa  310  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.06 
 
 
600 aa  310  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.78 
 
 
581 aa  310  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.17 
 
 
566 aa  310  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  35.2 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.46 
 
 
563 aa  309  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  35.71 
 
 
529 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.18 
 
 
591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.95 
 
 
567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  34.36 
 
 
533 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.29 
 
 
598 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.27 
 
 
605 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.27 
 
 
605 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>